そう、誰もが気になる「車検」のこと。私も心配だったので販売元のレアバリュージャパン様に問い合わせたところ、大変親切かつご丁寧に解答して頂けました。
####以下問い合わせに対するご回答です。####
後付サンルーフの規制緩和は下記のようになっております。
平成７年１１月１６日
自技第２３４号・自整第２６２号
各地方運輸局長・沖縄総合事務局長殿 ＜ー 自動車交通局長
【自動車部品を装着した場合の構造等変更検査時等における取扱いについて（依命通達）】
自技第２３５号
各地方運輸局長・沖縄総合事務局長殿 ＜ー 自動車交通局技術安全部技術課長
【自動車部品を装着した場合の構造等変更検査時等における取扱いについて（依命通達）の細部取扱いについて】
１アクセサリー等の自動車部品
1.車体まわり関係
(3)その他の部品
サンルーフ
上記の項目に明記されております。
上記の内容では、恒久的な装着に関しては、長さ(+-3cm)、幅(+-2cm)、高さ(+-4cm)、車両重量(+-50kg)という規定があります。従いまして、高さも車両重量も規定内ですので何ら問題ないものと思います。
####以上####
つまり、そのまま車検にも通りますし、構造変更等の手続きは必要ありません（ツインルーフにおいても同様です）。
えー、私自身ツインルーフと言うこともあり「廃車覚悟」だったので、念の為このサンルーフ取り付けは車検約1週間前に行いました。で、約1週間後の2003年2月27日に車検を「日産サティオ湘南」で受けましたが、なんら問題なく通りました（車自体はだいぶガタがきていたけど…）。
と言うことなので、車検を気にせず気軽に取り付けてみてください。